トップガン史上最高のパイロットでありながら、常識破りな性格と組織に縛られない振る舞いから、昇進せず現役を続けるマーヴェリック。彼がトップガンに戻り、新世代のパイロットたちと究極のミッションに命を懸ける理由とは?